公司购车发票用于上户后才发现税号问题不能认证，怎么办？

小A最近遇到一个事情挺心烦，公司新购买了一辆小汽车，综管部把发票拿给小A时候，小A也没多注意，但是等月底去税务局认证时候才发现，发票把公司的税号开错了，没法认证。小A马上联系了综管部让换票，可是得到的回复是4S点说要收齐所有发票才能换票，但是其中第三联和第四联已经要不回来了。第三联给了税务局，第四联车管所收了。怎么办？几万的进项税呢，就白白损失了？

从事机动车零售业务的单位和个人，在销售机动车（不包括销售旧机动车）收取款项时，开具机动车销售统一发票。机动车销售统一发票为电脑六联式发票：第一联为发票联，是购货单位付款凭证；第二联为抵扣联，是购货单位扣税凭证；第三联为报税联，车购税征收单位留存；第四联为注册登记联，车辆登记单位留存；第五联为记账联，销货单位记账凭证；第六联为存根联，销货单位留存。

4S店告诉小A，如果发票作废按照发票管理办法，需要全联次收回方可以作废，如果是跨月红字，购买方未认证情况，也需要全联次收回方可红字冲销。所以联次不够，4S不会重新开具的。

小A最后找车管所开了证明又和4S协商了很久，把发票管理办法实施细则都研究给4S听，说如果发票收不回，能取的有效证明也是可以红字冲销的，4S才重新给他们开了发票。

第二十七条 开具发票后，如发生销货退回需开红字发票的，必须收回原发票并注明“作废”字样或取得对方有效证明。
　　

开具发票后，如发生销售折让的，必须在收回原发票并注明“作废”字样后重新开具销售发票或取得对方有效证明后开具红字发票。

但是这件事情后，小A还是给综管部沟通了，以后购车先把发票认证了再去上户，这样换票实在太折腾。而且还不知道4S是否承担了风险。